From c6944440507b4b793a3715704122dfffb350a5a0 Mon Sep 17 00:00:00 2001 From: Johannes Ranke Date: Wed, 9 Dec 2020 11:35:59 +0100 Subject: Try other mixed fits for vdiffr on travis --- .../plotting/mixed-model-fit-for-mmkin-object.svg | 3037 ++++---------------- ...for-saem-object-with-saemix-transformations.svg | 3037 ++++---------------- tests/testthat/setup_script.R | 14 + tests/testthat/test_plot.R | 12 +- 4 files changed, 1290 insertions(+), 4810 deletions(-) diff --git a/tests/figs/plotting/mixed-model-fit-for-mmkin-object.svg b/tests/figs/plotting/mixed-model-fit-for-mmkin-object.svg index 97252960..c45b8deb 100644 --- a/tests/figs/plotting/mixed-model-fit-for-mmkin-object.svg +++ b/tests/figs/plotting/mixed-model-fit-for-mmkin-object.svg @@ -13,720 +13,209 @@ - - + + - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -Population -1 -2 -3 -4 -5 -6 -7 -8 -9 -10 -11 -12 -13 -14 -15 + + + + + + + + + + + + + +Population +Dataset 6 +Dataset 7 +Dataset 8 +Dataset 9 +Dataset 10 - - + + - + - - - - - - - - -0 -20 -40 -60 -80 -100 -120 - - - - - - - -0 -20 -40 -60 -80 -100 - + + + + + +0 +50 +100 +150 + + + + + + + +0 +20 +40 +60 +80 +100 + - - + + -Time -parent +Time +parent - - + + - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 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-0 -20 -40 -60 -80 -100 - + + + + + +0 +50 +100 +150 + + + + + + + +0 +20 +40 +60 +80 +100 + - - + + -Time -parent +Time +parent - - + + - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 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- + + - + - + - - - - + + - 0 -20 -40 -60 -80 -100 -120 - - - - - - -0 -10 -20 -30 -40 - +50 +100 +150 + + + + + + + +0 +5 +10 +15 +20 +25 + - - + + -Time -m1 +Time +A1 - - + + - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 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plot_biphasic_mmkin <- function() plot(mixed(mmkin_biphasic)) plot_biphasic_nlme <- function() plot(nlme_biphasic) - plot_biphasic_saem_s <- function() plot(saem_biphasic_s) + #plot_biphasic_saem_s <- function() plot(saem_biphasic_s) plot_biphasic_saem_m <- function() plot(saem_biphasic_m) - vdiffr::expect_doppelganger("mixed model fit for mmkin object", plot_biphasic_mmkin) vdiffr::expect_doppelganger("mixed model fit for nlme object", plot_biphasic_nlme) - vdiffr::expect_doppelganger("mixed model fit for saem object with saemix transformations", plot_biphasic_saem_s) vdiffr::expect_doppelganger("mixed model fit for saem object with mkin transformations", plot_biphasic_saem_m) # different results when working with eigenvalues -- cgit v1.2.1