reference\dev\docs - mkin - Fitting kinetic models to chemical degradation data (also on github)

Mode	Name	Size
-rw-r--r--	AIC.mmkin.html	15870	log plain blame
-rw-r--r--	BIC.mmkin.html	278	log plain blame
-rw-r--r--	CAKE_export.html	11731	log plain blame
-rw-r--r--	D24_2014.html	20315	log plain blame
-rw-r--r--	DFOP.solution-1.png	31964	log plain blame
-rw-r--r--	DFOP.solution.html	11668	log plain blame
-rw-r--r--	Extract.mmkin.html	14677	log plain blame
-rw-r--r--	FOCUS_2006_A.html	298	log plain blame
-rw-r--r--	FOCUS_2006_B.html	298	log plain blame
-rw-r--r--	FOCUS_2006_C.html	298	log plain blame
-rw-r--r--	FOCUS_2006_D.html	298	log plain blame
-rw-r--r--	FOCUS_2006_DFOP_ref_A_to_B.html	10147	log plain blame
-rw-r--r--	FOCUS_2006_E.html	298	log plain blame
-rw-r--r--	FOCUS_2006_F.html	298	log plain blame
-rw-r--r--	FOCUS_2006_FOMC_ref_A_to_F.html	10089	log plain blame
-rw-r--r--	FOCUS_2006_HS_ref_A_to_F.html	10133	log plain blame
-rw-r--r--	FOCUS_2006_SFO_ref_A_to_F.html	10025	log plain blame
-rw-r--r--	FOCUS_2006_datasets.html	9805	log plain blame
-rw-r--r--	FOMC.solution-1.png	29520	log plain blame
-rw-r--r--	FOMC.solution.html	12352	log plain blame
-rw-r--r--	HS.solution-1.png	29572	log plain blame
-rw-r--r--	HS.solution.html	11628	log plain blame
-rw-r--r--	IORE.solution-1.png	30800	log plain blame
-rw-r--r--	IORE.solution.html	15834	log plain blame
-rw-r--r--	NAFTA_SOP_2015-1.png	63875	log plain blame
-rw-r--r--	NAFTA_SOP_2015.html	13940	log plain blame
-rw-r--r--	NAFTA_SOP_Appendix_B.html	288	log plain blame
-rw-r--r--	NAFTA_SOP_Appendix_D.html	288	log plain blame
-rw-r--r--	NAFTA_SOP_Attachment-1.png	65176	log plain blame
-rw-r--r--	NAFTA_SOP_Attachment.html	13549	log plain blame
-rw-r--r--	SFO.solution-1.png	29614	log plain blame
-rw-r--r--	SFO.solution.html	10864	log plain blame
-rw-r--r--	SFORB.solution-1.png	31673	log plain blame
-rw-r--r--	SFORB.solution.html	12262	log plain blame
-rw-r--r--	[.mhmkin.html	272	log plain blame
-rw-r--r--	add_err-1.png	109428	log plain blame
-rw-r--r--	add_err-2.png	64140	log plain blame
-rw-r--r--	add_err-3.png	59180	log plain blame
-rw-r--r--	add_err.html	19493	log plain blame
-rw-r--r--	anova.saem.mmkin.html	10215	log plain blame
-rw-r--r--	aw.html	13544	log plain blame
-rw-r--r--	aw.mixed.mmkin.html	264	log plain blame
-rw-r--r--	aw.mkinfit.html	264	log plain blame
-rw-r--r--	aw.mmkin.html	264	log plain blame
-rw-r--r--	aw.multistart.html	264	log plain blame
-rw-r--r--	backtransform_odeparms.html	296	log plain blame
-rw-r--r--	best.default.html	280	log plain blame
-rw-r--r--	best.html	280	log plain blame
-rw-r--r--	check_failed.html	7786	log plain blame
-rw-r--r--	confint.mkinfit.html	41782	log plain blame
-rw-r--r--	create_deg_func.html	15698	log plain blame
-rw-r--r--	dimethenamid_2018-1.png	253131	log plain blame
-rw-r--r--	dimethenamid_2018.html	37642	log plain blame
-rw-r--r--	ds_dfop.html	276	log plain blame
-rw-r--r--	ds_dfop_sfo.html	276	log plain blame
-rw-r--r--	ds_fomc.html	276	log plain blame
-rw-r--r--	ds_hs.html	276	log plain blame
-rw-r--r--	ds_mixed-1.png	219327	log plain blame
-rw-r--r--	ds_mixed.html	19879	log plain blame
-rw-r--r--	ds_sfo.html	276	log plain blame
-rw-r--r--	endpoints.html	14709	log plain blame
-rw-r--r--	experimental_data_for_UBA-1.png	103371	log plain blame
-rw-r--r--	experimental_data_for_UBA.html	22114	log plain blame
-rw-r--r--	f_time_norm_focus.html	15502	log plain blame
-rw-r--r--	f_time_norm_focus.mkindsg.html	294	log plain blame
-rw-r--r--	f_time_norm_focus.numeric.html	294	log plain blame
-rw-r--r--	focus_soil_moisture.html	10017	log plain blame
-rw-r--r--	get_deg_func.html	7789	log plain blame
-rw-r--r--	hierarchical_kinetics.html	12258	log plain blame
-rw-r--r--	html_listing.html	290	log plain blame
-rw-r--r--	illparms.html	16511	log plain blame
-rw-r--r--	illparms.mhmkin.html	276	log plain blame
-rw-r--r--	illparms.mkinfit.html	276	log plain blame
-rw-r--r--	illparms.mmkin.html	276	log plain blame
-rw-r--r--	illparms.saem.mmkin.html	276	log plain blame
-rw-r--r--	ilr.html	16029	log plain blame
-rw-r--r--	index.html	29541	log plain blame
-rw-r--r--	intervals.html	278	log plain blame
-rw-r--r--	intervals.saem.mmkin.html	9121	log plain blame
-rw-r--r--	invilr.html	266	log plain blame
-rw-r--r--	llhist.html	9189	log plain blame
-rw-r--r--	loftest-1.png	40997	log plain blame
-rw-r--r--	loftest-2.png	40551	log plain blame
-rw-r--r--	loftest-3.png	78294	log plain blame
-rw-r--r--	loftest-4.png	75822	log plain blame
-rw-r--r--	loftest-5.png	74615	log plain blame
-rw-r--r--	loftest.html	35180	log plain blame
-rw-r--r--	loftest.mkinfit.html	274	log plain blame
-rw-r--r--	logLik.mkinfit.html	13594	log plain blame
-rw-r--r--	logLik.saem.mmkin.html	8678	log plain blame
-rw-r--r--	logistic.solution-1.png	81046	log plain blame
-rw-r--r--	logistic.solution-2.png	44080	log plain blame
-rw-r--r--	logistic.solution.html	23287	log plain blame
-rw-r--r--	lrtest.html	278	log plain blame
-rw-r--r--	lrtest.mkinfit.html	17924	log plain blame
-rw-r--r--	lrtest.mmkin.html	288	log plain blame
-rw-r--r--	max_twa_dfop.html	288	log plain blame
-rw-r--r--	max_twa_fomc.html	288	log plain blame
-rw-r--r--	max_twa_hs.html	288	log plain blame
-rw-r--r--	max_twa_parent.html	13811	log plain blame
-rw-r--r--	max_twa_sfo.html	288	log plain blame
-rw-r--r--	mccall81_245T-1.png	62916	log plain blame
-rw-r--r--	mccall81_245T.html	20407	log plain blame
-rw-r--r--	mean_degparms.html	9752	log plain blame
-rw-r--r--	mhmkin-1.png	53533	log plain blame
-rw-r--r--	mhmkin-2.png	112620	log plain blame
-rw-r--r--	mhmkin.html	26867	log plain blame
-rw-r--r--	mhmkin.list.html	272	log plain blame
-rw-r--r--	mhmkin.mmkin.html	272	log plain blame
-rw-r--r--	mixed-1.png	215777	log plain blame
-rw-r--r--	mixed.html	22597	log plain blame
-rw-r--r--	mixed.mmkin.html	270	log plain blame
-rw-r--r--	mkin_long_to_wide.html	11711	log plain blame
-rw-r--r--	mkin_wide_to_long.html	11051	log plain blame
-rw-r--r--	mkinds.html	13635	log plain blame
-rw-r--r--	mkindsg.html	30779	log plain blame
-rw-r--r--	mkinerrmin.html	13656	log plain blame
-rw-r--r--	mkinerrplot-1.png	41444	log plain blame
-rw-r--r--	mkinerrplot.html	15079	log plain blame
-rw-r--r--	mkinfit-1.png	65304	log plain blame
-rw-r--r--	mkinfit.html	61445	log plain blame
-rw-r--r--	mkinmod.html	31892	log plain blame
-rw-r--r--	mkinparplot-1.png	26968	log plain blame
-rw-r--r--	mkinparplot.html	11387	log plain blame
-rw-r--r--	mkinplot.html	8574	log plain blame
-rw-r--r--	mkinpredict.html	43555	log plain blame
-rw-r--r--	mkinpredict.mkinfit.html	282	log plain blame
-rw-r--r--	mkinpredict.mkinmod.html	282	log plain blame
-rw-r--r--	mkinresplot-1.png	24037	log plain blame
-rw-r--r--	mkinresplot.html	15297	log plain blame
-rw-r--r--	mkinsub.html	274	log plain blame
-rw-r--r--	mmkin-1.png	111703	log plain blame
-rw-r--r--	mmkin-2.png	108899	log plain blame
-rw-r--r--	mmkin-3.png	96986	log plain blame
-rw-r--r--	mmkin-4.png	67584	log plain blame
-rw-r--r--	mmkin-5.png	65242	log plain blame
-rw-r--r--	mmkin.html	25819	log plain blame
-rw-r--r--	multistart-1.png	68074	log plain blame
-rw-r--r--	multistart-2.png	56348	log plain blame
-rw-r--r--	multistart.html	21755	log plain blame
-rw-r--r--	multistart.saem.mmkin.html	280	log plain blame
-rw-r--r--	nafta-1.png	63875	log plain blame
-rw-r--r--	nafta.html	16878	log plain blame
-rw-r--r--	nlme-1.png	78105	log plain blame
-rw-r--r--	nlme-2.png	90362	log plain blame
-rw-r--r--	nlme.html	24073	log plain blame
-rw-r--r--	nlme.mmkin-1.png	123589	log plain blame
-rw-r--r--	nlme.mmkin-2.png	169384	log plain blame
-rw-r--r--	nlme.mmkin-3.png	173476	log plain blame
-rw-r--r--	nlme.mmkin.html	44990	log plain blame
-rw-r--r--	nlme_data.html	268	log plain blame
-rw-r--r--	nobs.mkinfit.html	8416	log plain blame
-rw-r--r--	parms.html	23188	log plain blame
-rw-r--r--	parms.mkinfit.html	270	log plain blame
-rw-r--r--	parms.mmkin.html	270	log plain blame
-rw-r--r--	parms.multistart.html	270	log plain blame
-rw-r--r--	parms.saem.mmkin.html	270	log plain blame
-rw-r--r--	parplot.html	11220	log plain blame
-rw-r--r--	parplot.multistart.saem.mmkin.html	274	log plain blame
-rw-r--r--	plot.mixed.mmkin-1.png	86863	log plain blame
-rw-r--r--	plot.mixed.mmkin-2.png	174836	log plain blame
-rw-r--r--	plot.mixed.mmkin-3.png	173680	log plain blame
-rw-r--r--	plot.mixed.mmkin-4.png	176755	log plain blame
-rw-r--r--	plot.mixed.mmkin.html	28573	log plain blame
-rw-r--r--	plot.mkinfit-1.png	53909	log plain blame
-rw-r--r--	plot.mkinfit-2.png	74783	log plain blame
-rw-r--r--	plot.mkinfit-3.png	69703	log plain blame
-rw-r--r--	plot.mkinfit-4.png	73776	log plain blame
-rw-r--r--	plot.mkinfit-5.png	66319	log plain blame
-rw-r--r--	plot.mkinfit-6.png	72434	log plain blame
-rw-r--r--	plot.mkinfit-7.png	73460	log plain blame
-rw-r--r--	plot.mkinfit.html	26082	log plain blame
-rw-r--r--	plot.mmkin-1.png	49892	log plain blame
-rw-r--r--	plot.mmkin-2.png	51179	log plain blame
-rw-r--r--	plot.mmkin-3.png	47146	log plain blame
-rw-r--r--	plot.mmkin-4.png	33484	log plain blame
-rw-r--r--	plot.mmkin-5.png	59021	log plain blame
-rw-r--r--	plot.mmkin.html	17823	log plain blame
-rw-r--r--	plot.nafta.html	9389	log plain blame
-rw-r--r--	plot_err.html	284	log plain blame
-rw-r--r--	plot_res.html	284	log plain blame
-rw-r--r--	plot_sep.html	284	log plain blame
-rw-r--r--	print.illparms.mhmkin.html	276	log plain blame
-rw-r--r--	print.illparms.mkinfit.html	276	log plain blame
-rw-r--r--	print.illparms.mmkin.html	276	log plain blame
-rw-r--r--	print.illparms.saem.mmkin.html	276	log plain blame
-rw-r--r--	print.mhmkin.html	272	log plain blame
-rw-r--r--	print.mixed.mmkin.html	270	log plain blame
-rw-r--r--	print.mkinds.html	272	log plain blame
-rw-r--r--	print.mkindsg.html	274	log plain blame
-rw-r--r--	print.mkinmod.html	274	log plain blame
-rw-r--r--	print.mmkin.html	270	log plain blame
-rw-r--r--	print.multistart.html	280	log plain blame
-rw-r--r--	print.nafta.html	270	log plain blame
-rw-r--r--	print.nlme.mmkin.html	280	log plain blame
-rw-r--r--	print.saem.mmkin.html	268	log plain blame
-rw-r--r--	print.status.mhmkin.html	272	log plain blame
-rw-r--r--	print.status.mmkin.html	272	log plain blame
-rw-r--r--	print.summary.mkinfit.html	290	log plain blame
-rw-r--r--	print.summary.mmkin.html	286	log plain blame
-rw-r--r--	print.summary.nlme.mmkin.html	296	log plain blame
-rw-r--r--	print.summary.saem.mmkin.html	296	log plain blame
-rw-r--r--	read_spreadsheet.html	11354	log plain blame
-rw-r--r--	reexports.html	7916	log plain blame
-rw-r--r--	residuals.mkinfit.html	9996	log plain blame
-rw-r--r--	saem-1.png	55172	log plain blame
-rw-r--r--	saem-2.png	49938	log plain blame
-rw-r--r--	saem-3.png	128590	log plain blame
-rw-r--r--	saem-4.png	174573	log plain blame
-rw-r--r--	saem.html	81074	log plain blame
-rw-r--r--	saem.mmkin.html	268	log plain blame
-rw-r--r--	saemix_data.html	268	log plain blame
-rw-r--r--	saemix_model.html	268	log plain blame
-rw-r--r--	schaefer07_complex_case-1.png	67631	log plain blame
-rw-r--r--	schaefer07_complex_case.html	16098	log plain blame
-rw-r--r--	schaefer07_complex_results.html	306	log plain blame
-rw-r--r--	set_nd_nq.html	24508	log plain blame
-rw-r--r--	set_nd_nq_focus.html	278	log plain blame
-rw-r--r--	sigma_twocomp-1.png	44956	log plain blame
-rw-r--r--	sigma_twocomp.html	18362	log plain blame
-rw-r--r--	status.html	11577	log plain blame
-rw-r--r--	status.mhmkin.html	272	log plain blame
-rw-r--r--	status.mmkin.html	272	log plain blame
-rw-r--r--	summary.mkinfit.html	20617	log plain blame
-rw-r--r--	summary.mmkin.html	13084	log plain blame
-rw-r--r--	summary.nlme.mmkin.html	38088	log plain blame
-rw-r--r--	summary.saem.mmkin.html	70056	log plain blame
-rw-r--r--	summary_listing.html	9338	log plain blame
-rw-r--r--	synthetic_data_for_UBA_2014-1.png	67584	log plain blame
-rw-r--r--	synthetic_data_for_UBA_2014.html	49735	log plain blame
-rw-r--r--	test_data_from_UBA_2014-1.png	57059	log plain blame
-rw-r--r--	test_data_from_UBA_2014-2.png	73973	log plain blame
-rw-r--r--	test_data_from_UBA_2014.html	20662	log plain blame
-rw-r--r--	tex_listing.html	290	log plain blame
-rw-r--r--	transform_odeparms.html	31935	log plain blame
-rw-r--r--	update.mkinfit-1.png	44121	log plain blame
-rw-r--r--	update.mkinfit-2.png	44072	log plain blame
-rw-r--r--	update.mkinfit.html	11758	log plain blame
-rw-r--r--	update.nlme.mmkin.html	280	log plain blame
-rw-r--r--	which.best.default.html	280	log plain blame
-rw-r--r--	which.best.html	280	log plain blame